Zygota alebo vajíčko je diploidná bunka, ktorá je výsledkom spojenia jadier dvoch vzájomne kompatibilných buniek. Je to produkt sexuálnej reprodukcie.
U zvierat sa zygota nazýva vajce a je výsledkom spojenia dvoch gamét. Je to bunka schopná ukladať genetické vlastnosti rodičov, ktorí sú schopní generovať všetky bunkové línie organizmu dospelý.
Zygota je bunka vytvorená spojením mužských a ženských gamét, ktorá prostredníctvom diferenciácie a embryogenézy dá vznik novej bytosti druhu, predovšetkým vo forme embrya. V konkrétnom prípade človeka má zygota 23 párov chromozómov, to znamená 46.
V rastlinách zygota spôsobí sporofyt, štádium, ktoré produkuje spóry; klíčením týchto spór vzniká gametofyt, schopný produkovať haploidné gaméty.
U spermatofytov sa zygota najskôr vyvinie do embrya, ktoré leží v semene, zatiaľ čo u pteridofytov sa zygota vyvinie priamo do dospelej rastliny.
V hubách je zygota bunka, ktorá vzniká spojením jadier dvoch sexuálne kompatibilných hýf a vedie k vzniku zygospory, ktorý produkuje novú hyfu, ktorej jadrá prechádzajú cez meiózu a vytvárajú spóry schopné vyvinúť sa do nových jedincov haploidy.
Pozri tiež význam slova Hnojenie a Fetálny vývoj a stretnúť sa s Typy reprodukcie: nepohlavné a sexuálne.