Saared on sageli populaarsed turismisihtkohad oma loodusliku ilu, ainulaadsete ökosüsteemide ja kultuuriliste vaatamisväärsuste tõttu. Need võivad olla ka olulised ökonoomne märkimisväärne strateegiline mõju, peamiselt suurte rannajoontega riikidele või oluliste mereteedega piirkondadele.
Jaapanit ümbritsevad saared on olnud mitmete territoriaalsete vaidluste keskmes.
Seda seetõttu, et Jaapan võtab endale Venemaa kontrolli all olevad Lõuna-Kuriili saared, mida Tokyo nimetab territooriumiteks. vaidlus, mis pärineb II maailmasõja lõpust, kui Nõukogude väed võtsid nad sealt ära Jaapan.
Jaapan teatab, et tal on ajalooline nõue Ida-Hiina meres asuvatele asustamata Senkaku saartele, mida ta praegu haldab, kuid Hiina on selle korduvalt vaidlustanud.
Jaapan ja Lõuna-Korea on endiselt lukus enam kui 70 aastat kestnud vaidluses grupi suveräänsuse üle. Soulis tuntud kui Dokdo ja Tokyo Takeshima Jaapani meres, mida Korea nimetab mereks Ida.
Honshu saar on Jaapani saartest suurim ja rahvarohkeim, kus asuvad riigi suurimad linnad nagu Tokyo, Osaka ja Yokohama. Hokkaido, suuruselt teine saar, asub põhja pool ja on tuntud oma kauni loodusmaastiku, sealhulgas mägede, järvede ja rahvusparkide poolest.
Kyushu, suuruselt kolmas saar, asub riigi edelaosas ja on koduks suurematele linnadele nagu Fukuoka ja Nagasaki. Shikoku on neljast peamisest saarest väikseim, mis asub Honshust lõuna pool ja on kuulus oma budistlike templite ja religioossete palverännakute poolest.
