Zygota nebo vejce je diploidní buňka vznikající spojením jader dvou vzájemně kompatibilních buněk. To je produkt sexuální reprodukce.
U zvířat se zygota nazývá vejce a je výsledkem spojení dvou gamet, je to buňka schopná uchovávat genetické vlastnosti rodičů, kteří jsou schopni generovat všechny buněčné linie organismu dospělý.
Zygota je buňka vytvořená fúzí mužských a ženských gamet, která díky diferenciaci a embryogenezi povede k nové bytosti druhu, především ve formě embrya. Ve specifickém případě člověka má zygota 23 párů chromozomů, tedy 46.
V rostlinách zygota vyvolá sporofyt, stádium, které produkuje spory; klíčení těchto spor vyvolává gametofyt, schopný produkovat haploidní gamety.
U spermatofytů se zygota nejprve vyvine do embrya, které leží uvnitř semene, zatímco u pteridofytů se zygota vyvine přímo do dospělé rostliny.
U hub je zygota buňka vzniklá fúzí jader dvou sexuálně kompatibilních hyf a vede k zygospore, který produkuje novou hyfu, jejíž jádra projdou meiózou a generují spory schopné vyvinout se v nové jedince haploidy.
Viz také význam Oplodnění a Fetální vývoj a setkat se s Typy reprodukce: nepohlavní a sexuální.