Missionario gesuita spagnolo nato nel castello di Xavier, in Navarra, compagno di Ignazio di Loyola e considerato dalla Chiesa l'Apostolo delle Indie e patrono universale delle missioni. Ha studiato filosofia all'Università di Parigi, città dove ha incontrato Inácio de Loiola, al Collegio Santa Barbara, con la quale ha condiviso una stanza per studenti. Attratto dalla personalità di colui che sarebbe diventato il fondatore della Compagnia di Gesù, iniziò a collaborare al suo progetto. Entrambi presero i voti di povertà e castità nella chiesa di Montmartre (1534) e poi decisero di recarsi in Terra Santa per predicare agli eretici. Fu ordinato (1537), due anni prima della fondazione della Compagnia di Gesù.
Attraverso d. João III, re del Portogallo, e senza trovare compagni, lasciò Lisbona da solo (1541) per evangelizzare le terre portoghesi delle Indie, investite della dignità di un lascito papale. Dopo aver navigato per un anno intero e aver fatto scalo in Madagascar, è arrivato a Goa, sulla costa dell'India sudoccidentale, per dedicarsi alla cura dei poveri e dei malati e all'insegnamento della dottrina Cristiano. Fu poi sulla Costa da Pescaria, dove battezzò oltre ventimila indigeni e tornato a Goa, si recò a Malacca e alle isole Molucche.
A Malacca battezzò un giovane giapponese, Anjiro, che lo spinse a recarsi a Kagoshima (1549) per l'evangelizzazione del Giappone. Con altri due gesuiti e Anjiro iniziò la sua opera apostolica ed entrò in contatto con le più alte personalità del paese e perfino con l'imperatore. Andò poi in Cina, ma dopo lo sbarco fu colpito da una polmonite e morì sull'isola di Sancian, poi Shangchuan, vicino a Canton. Fu canonizzato da papa Gregorio XV (1622).
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